Doutorado em Genética e Melhoramento
URI Permanente para esta coleção
Nível: Doutorado
Ano de início: 2013
Conceito atual na CAPES: 5
Ato normativo: Homologado pelo CNE/CES Parecer nº 250/2014, portaria nº 187 de 06/03/2015, publicado no DOU de 09/03/2015 seção 1, página 11
Periodicidade de seleção: Semestral
Área(s) de concentração: Genética e Melhoramento
Url do curso: https://geneticaemelhoramento.ufes.br/pt-br/pos-graduacao/PPGGM/detalhes-do-curso?id=1416
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Submissões Recentes
- ItemCaracterização morfoagronômica, parâmetros genéticos e seleção de pimenteiras (Capsicum annuum L.) Para fins ornamentais(Universidade Federal do Espírito Santo, 2025-09-19) Almeida, Rafael de; Moulin, Monique Moreira; https://orcid.org/0000-0001-8993-4835; http://lattes.cnpq.br/8654999153826715; Bento, Cintia dos Santos; https://orcid.org/0000-0003-1639-4166; http://lattes.cnpq.br/4236145191829946; https://orcid.org/0000-0002-9016-365X; http://lattes.cnpq.br/1188817615353483; Santos, Marilene Hilma dos; https://orcid.org/0009-0008-1491-0538; http://lattes.cnpq.br/2955792197623296; Pimenta, Samy; https://orcid.org/0000-0002-9411-9381; http://lattes.cnpq.br/8309922560278535; Almeida, Rafael Nunes de; https://orcid.org/0000-0003-4594-0437; http://lattes.cnpq.br/3859770824853982; Valadares, Fernanda Vargas; https://orcid.org/0000-0002-6451-7194; http://lattes.cnpq.br/9936954712375033Peppers of the genus Capsicum have great ornamental potential because they have characteristics that draw the attention of the consumer, such as: the compact architecture of the plants, the variations found in their leaves and the varied color and sizes of their fruits, in addition to their ease of cultivation. However, studies for the development of plants for ornamental purposes are still scarce. Thus, the objective was to continue the genetic improvement program of pepper trees species Capsicum annuum L., aiming at the ornamental potential. Six generations were evaluated, namely: Pi (female parent), P2 (male parent), FI (first hybrid generation), F2 (first generation of self-fertilization), ORI (backcross 1 = P1 x F1) and OR2 (backcross 2-P2 x F1). The plant materials were sown in 128-cell Styrofoam trays with organo-vegetal substrate and, after the emergence of two pairs of definitive leaves, the seedlings were transplanted into pots of 2 L volume, filled with a mixture of soil, sand and manure, in a ratio of 1:1:1. The design used was the completely randomized design (DIC) and the morphoagronomic characteristics of nine quantitative and 18 qualitative descriptors were evaluated. Pearson's linear correlation (r), generation mean analysis was performed, and the selection index was applied: Smith and Hazel, Pesek and Baker, Williams, Mulamba and Mock, and Ideotype Distance. Among the models in non-orthogonal decomposition, the additive gene effect stood out for the determination of the descriptors: stem length, total fruit mass, average fruit mass, fruit length and fruit diameter. For the selection index, the Ideotype Distance was the most appropriate in terms of identifying superior individuals. In addition, the ornamental potential of the material was observed through the characterization of the different generations, 3 verifying the existence of morphoagronomic variability that will contribute to the advancement of promising genotypes in the genetic improvement program of pepper plants of the species Capsicum annuum.
- ItemDerivados triazólicos fluorados de eugenol e timol: avaliação fitocitogenotóxica, atividade herbicida e mecanismos de ação em plantas invasoras(Universidade Federal do Espírito Santo, 2025-09-24) Oliveira, Jéssika Santos de; Costa, Adilson Vidal; https://orcid.org/0000-0002-7968-8586; http://lattes.cnpq.br/1638000107452454; Fontes, Milene Miranda Praça; https://orcid.org/0000-0001-7738-9518; http://lattes.cnpq.br/1372644511398549; https://orcid.org/0000-0001-7083-915X; http://lattes.cnpq.br/2560755246910637; Vasconcelos, Loren Cristina; https://orcid.org/0000-0002-0268-8529; http://lattes.cnpq.br/4002777926357414; Oliveira, João Paulo de Morais; https://orcid.org/0000-0001-9780-9807; http://lattes.cnpq.br/8146032394984908; Menini, Luciano; https://orcid.org/0000-0003-3656-5428; http://lattes.cnpq.br/2646344913961349; Teixeira, Róbson Ricardo; https://orcid.org/0000-0003-3181-1108; http://lattes.cnpq.br/6104660258664620A resistência de plantas daninhas a herbicidas e os impactos ambientais dos agroquímicos demandam o desenvolvimento de alternativas seletivas e sustentáveis. Este estudo avaliou o potencial herbicida de duas classes de compostos bioativos: derivados 1,2,3-triazólicos fluorados do eugenol e derivados 1,2,3-triazólicos do timol. Os bioensaios iniciais de fitocitogenotoxicidade foram realizados em Lactuca sativa L. para triar os compostos mais eficientes e avaliar danos celulares. No capítulo 1, seis de onze derivados de eugenol (3b, 3c, 3d, 3e, 3f, 3g) foram selecionados. No capítulo 2, quatro de oito derivados de timol (3a, 3b, 3c, 3h) foram selecionados. Ambos os tratamentos induziram efeitos genotóxicos e citotóxicos em L. sativa, incluindo núcleos condensados, alterações cromossômicas (pontes, aderências, cromossomos perdidos, c-metáfases) e redução do índice mitótico, com ação aneugênica e clastogênica. Os compostos selecionados foram testados em bioensaios de pré e pós-emergência contra as plantas daninhas Bidens pilosa L. (eudicotiledônea) e Lolium multiflorum Lam. (monocotiledônea). No primeiro capítulo (eugenol), em pré-emergência, os compostos exerceram maior efeito fitotóxico em B. pilosa. Em pós-emergência, causaram redução do comprimento aéreo apenas em L. multiflorum. Verificou-se um aumento de compostos fenólicos em B. pilosa, enquanto em L. multiflorum houve redução da clorofila a (compostos 3b e 3d) e de compostos fenólicos. No segundo capítulo (timol), em pré-emergência, os triazóis também exerceram maior efeito fitotóxico em B. pilosa. Em pós-emergência, não houve efeito significativo no comprimento das plantas, mas observou-se queima e amarelamento foliar em L. multiflorum, indicando ação de contato sem translocação eficiente. Ainda em L. multiflorum, houve redução no conteúdo de clorofila a e b (compostos 3c e 3h) e redução de compostos fenólicos (3a, 3c e 3h). Conclui-se que os derivados de ambas as classes apresentam efeito herbicida de pré-emergência não seletivo, porém mais eficaz em B. pilosa, com um possível modo de ação sistêmico. Os derivados do eugenol demonstraram também efeito em pós-emergência para L. multiflorum, enquanto os derivados do timol atuaram principalmente por ação de contato. Ambos os tratamentos possuem mecanismos de ação citogenotóxicos e bioquímicos distintos entre as espécies, configurando-se como candidatos promissores para o desenvolvimento de compostos herbicidas.
- ItemVariabilidade, seleção e associação genômica ampla para características de produção em café conilon(Universidade Federal do Espírito Santo, 2025-03-12) Couto, Diego Pereira do; Ferreira, Marcia Flores da Silva; https://orcid.org/0000-0003-1541-6634; http://lattes.cnpq.br/5719813884063445; Oliveira, Lidiane dos Santos Gomes; https://orcid.org/0000-0003-1245-7633; http://lattes.cnpq.br/8764402842768778; Bernardes, Carolina de Oliveira; Feirreira, Adésio; https://orcid.org/0000-0002-7000-1725; http://lattes.cnpq.br/5400370038397801; https://orcid.org/0000-0002-5660-7413; http://lattes.cnpq.br/4518653765839020; Zaidan, Iasmine Ramos; https://orcid.org/0000-0001-9115-4504; http://lattes.cnpq.br/1730496208019615; Souza, Elaine Manelli Riva; https://orcid.org/0009-0000-2067-8220; http://lattes.cnpq.br/2280132329500638; Amaral Júnior, Antônio Teixeira do ; https://orcid.org/0000-0003-4831-7878; http://lattes.cnpq.br/5063486824345109; Senra, João Felipe de Brites; https://orcid.org/0000-0001-7915-2821; http://lattes.cnpq.br/2268398576674753O Brasil é importante produtor global de Coffea canephora e o estado do Espírito Santo é o maior produtor nacional entregando cerca de 70% do total produzido no país. Este estudo avaliou 441 genótipos ao longo de dois anos, combinando análises fenotípicas e genômicas com o objetivo de realizar a seleção genômica e identificar associações genômicas amplas para características de produção em café conilon, a fim de contribuir para o desenvolvimento sustentável da cafeicultura, melhorar a produtividade dos genótipos dessa variedade e, assim, fortalecer a economia agrícola. Dentre estes genótipos 436 são de origem seminal e cinco são clones comerciais (A1, RO, P2, Verdin e RBS). As sementes foram coletadas de lavouras antigas no sul do Espírito Santo nos municípios de Alegre, Jerônimo Monteiro, Muqui, Mimoso do Sul e São Jose do Calçado. A fenotipagem foi realizada para sete características de produção, por dois anos, em um experimento no município de Mimoso do Sul, enquanto a genotipagem, baseada no método DArTseq™, permitiu a identificação de SNPs. O experimento foi implantado em 2018 em delineamento de Blocos Aumentados de Federer. Modelos mistos via REML/BLUP foram utilizados para estimar parâmetros genéticos, prever valores genotípicos e explorar a variabilidade. A análise de associação genômica ampla (GWAS) identificou 385 SNPs significativamente associados as características produtivas, sendo que 283 estavam inseridos ou próximos a genes candidatos. Esses SNPs revelaram relações com o desenvolvimento da planta e respostas a estresses, evidenciando o potencial da seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento do cafeeiro. A aplicação da Seleção Genômica Ampla (GWS) confirmou a eficiência da predição genômica na seleção de genótipos produtivos. Características como comprimento de ramos plagiotrópicos e peso de cem grãos apresentaram alta herdabilidade, garantindo maior precisão na seleção. Os genótipos 173.7.5, G114.5, G114.4 e G133.3 destacaram-se com ganhos expressivos, superando clones comerciais. Assim, a integração de análises fenotípicas e genômicas reforça o potencial das ferramentas (GWS e GWAS) para acelerar o melhoramento do C. canephora, contribuindo para a obtenção de cultivares mais produtivas e adaptadas
- ItemGenótipos seminais de matrizes antigas de Coffea canephora do sul do Espírito Santo: qualidade da bebida, diversidade genética, estrutura populacional e associação genômica ampla(Universidade Federal do Espírito Santo, 2025-02-18) Silva, Matheus Alves; Ferreira, Marcia Flores da Silva; https://orcid.org/ 0000-0003-1541-6634; http://lattes.cnpq.br/5719813884063445; Azevedo, Camila Ferreira ; https://orcid.org/0000-0003-0438-5123 ; http://lattes.cnpq.br/; Ferreira, Adésio; https://orcid.org/ 0000-0002-7000-1725 ; http://lattes.cnpq.br/5400370038397801; https://orcid.org/0000-0002-4992-9588; http://lattes.cnpq.br/4612290307365842; Ferreira, Marcia Flores da Silva; https://orcid.org/0000-0003-1541-6634; http://lattes.cnpq.br/5719813884063445; Fontes, Milene Miranda Praça; https://orcid.org/0000-0001-7738-9518; http://lattes.cnpq.br/1372644511398549; Oliveira, Eder Jorge de; https://orcid.org/0000-0001-8992-7459; http://lattes.cnpq.br/3533844615312370; Cecon, Paulo Roberto; https://orcid.org/0000-0001-8213-0199; http://lattes.cnpq.br/4525265173613927; Alexandre, Rodrigo Sobreira; https://orcid.org/0000-0002-5248-6773; http://lattes.cnpq.br/5340049196888351Conilon coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) was introduced to southern Espírito Santo in the early 20th century. Since the 1990s, old plantations have been renewed with clonal varieties, potentially reducing the genetic base. Thus, characterizing and preserving historical germplasm is critical, as it represents a potential source of genetic variability for breeding programs. This study aimed to evaluate seed-propagated genotypes of C. canephora derived from selected parent plants of old plantations in southern Espírito Santo, focusing on three aspects: (i) sensory attributes, final scores, and sensory profiles; (ii) genetic diversity and population structure; (iii) genome-wide association study (GWAS) for beverage quality traits. The experiment was established in April 2018 in Mimoso do Sul (ES), using Federer’s augmented block design with 1,940 plants distributed into 388 half sibling families and five commercial clones as controls. Beverage quality was assessed in 172 genotypes over two production years (2022 and 2023). For genetic diversity and population structure analysis, 649 genotypes (447 from the experiment and 202 provided by other institutions, including Conilon, Robusta, and morphological intermediates) were evaluated using single nucleotide polymorphism (SNP) markers generated by DArTseq™. GWAS included 370 experimental genotypes. All genotypes achieved a "Fine" classification (mean score: 81.92; range: 80.81–84.08). Attributes such as uniformity and clean cup received maximum scores, indicating defect-free profiles. Genotype clustering resulted in 11 groups, with commercial clones distributed across two clusters. Forty-eight sensory profiles were identified within the flavor wheel, along with 25 additional profiles not represented in the wheel, with varying predominance. Significant correlations were observed between sensory attributes/profiles and final scores. For genetic diversity and population structure, six clusters and K = 3 ancestral groups were identified using 1,654 SNPs. Cluster 1 (523 genotypes) comprised most seed-propagated genotypes from old plantations and commercial varieties. Cluster 4, containing intermediate genotypes, exhibited high heterozygosity (0.37) and negative FIS (-0.73), suggesting outbreeding. High FST values (0.80 and 0.71) indicated strong genetic divergence between cluster 1 (predominantly Conilon) and clusters 5–6 (mostly Robusta), composed of distinct ancestral groups. GWAS identified 246 significantly associated SNPs: 68 for final score, 40 for fragrance/aroma, 34 for flavor, 19 for aftertaste, 21 for acidity/saltiness, 11 for mouthfeel, 22 for balance, 15 for bitterness/sweetness, and 16 for overall quality. Of these, 148 SNPs were located on chromosomes 1–11, with 83 situated in gene sequences. Putative gene functions were annotated, and some markers were associated with multiple traits. Collectively, the results underscore the potential of southern Espírito Santo’s remnant germplasm for C. canephora breeding programs, combining superior sensory quality with genetic diversity. These genotypes are strategic resources for germplasm banks, safeguarding diversity against future challenges. The identified chromosomal regions enable marker-assisted selection for key beverage traits, optimizing the development of elite cultivars through precise genomic tools.
- ItemObtenção de híbridos de capsicum sp. com potencial ornamental e resistência ao colletotrichum scovillei(Universidade Federal do Espírito Santo, 2023-07-25) Peterle, Mariana Almeida Dos Santos; Bento, Cíntia dos Santos; https://orcid.org/0000000316394166; http://lattes.cnpq.br/4236145191829946; https://orcid.org/0000000257945529; http://lattes.cnpq.br/8005504621519299; Ferreira, Adesio; https://orcid.org/0000000270001725; http://lattes.cnpq.br/5400370038397801; Sudré, Cláudia Pombo; https://orcid.org/0000-0001-6743-7205; http://lattes.cnpq.br/4185732042391423; Xavier, André da Silva; https://orcid.org/0000000292510301; http://lattes.cnpq.br/5661020509713522; Oliveira, Fabio Luiz de; https://orcid.org/0000000217116988; http://lattes.cnpq.br/8904451083627425Peppers of the genus Capsicum have shown increasing interest in the ornamental plant market. The growth of its production and sale is related to the diversity of colors of the fruits, flowers and leaves, the compact architecture and the ease of harvesting the fruits. These plants are frequently affected by phytopathogenic diseases, such as anthracnose, caused by fungi of the genus Colletotrichum. Thus, it is necessary to search for cultivars that have ornamental potential and are resistant to anthracnose. This study aimed to carry out Value of Cultivation and Use (VCU) trials for seven Capsicum sp. hybrids, to evaluate their reaction to the fungus C. scovillei for the future registration of at least one of them in the National Cultivars Registry (RNC). The trials were carried out in two periods of the year. In the morphoagronomic characterizations, 47 characters were evaluated, 32 qualitative and 15 quantitative, in 16 different genotypes. The different genotypes were composed by the hybrids, the parents and the commercial checks ‘Espaguetinho Ornamental’ and ‘Pirâmide Ornamental’. Anthracnose resistance tests were carried on unripe and ripe fruits, on the 16 genotypes and on the Ikeda controls, considered susceptible to anthracnose, and UENF 1381, considered resistant. In addition, questionnaires were applied to find out the preference of 50 respondents in relation to the consumption of ornamental peppers. Most genotypes showed an intermediate growth habit and the presence of anthocyanin pigment at the height of the nodes. Stem color varied between green and green with purple stripes. The leaves of the plants showed a lanceolate shape for most genotypes. Most plants had one flower per axil, and the corolla color was white, white with a violet margin, violet with a white base, or violet. The genotypes UFES 15, UFES 23, 15x89, 23x40, 89x15 and the control ‘Pirâmide Ornamental’ were more closely related to the quantitative traits related to plant productivity, and showed less susceptibility to the fungus C. scovillei. Parents UFES 29, UFES 56, UFES 87, UFES 89 and hybrids 23x56, 29x40 and 87x40 showed a greater relationship with the characteristics crown diameter, stem diameter, plant height and stem length. All parents and hybrids were precocious in relation to ornamental controls, with less days for flowering and fruiting after transplanting. The hybrids 89x15 and 15x89 were chosen as preferred by the interviewed public. Parents UFES 15, UFES 23 and hybrids 15x89, 23x40, 23x56 and 89x15 present a greater number of characteristics required for the ornamental pepper market. These genotypes also demonstrated greater resistence to anthracnose. The 15x89, 23x40 and 89x15 hybrids are good candidates for RNC registration, and the UFES 15 and UFES 23 parents can be explored in future studies.