Caracterização de isolados de escherichia coli resistentes a antimicrobianos clinicamente importantes em bivalves marinhos nas cidades de Vitória e Vila Velha, Espírito Santo

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dc.contributor.advisor1Silva , Quézia Moura da
dc.contributor.advisor1IDhttps://orcid.org/0000-0002-3758-4148
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1778832016290387
dc.contributor.authorGaigher , Gustavo Venturin
dc.contributor.authorIDhttps://orcid.org/0009-0005-1576-5019
dc.contributor.referee1Silva, Rodrigo Cayô da
dc.contributor.referee1IDhttps://orcid.org/0000-0002-0709-6282
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5699739668358897
dc.contributor.referee2Santos, Kênia Valéria dos
dc.contributor.referee2IDhttps://orcid.org/0000-0001-6871-3128
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/9074173162086323
dc.date.accessioned2026-01-20T13:19:15Z
dc.date.available2026-01-20T13:19:15Z
dc.date.issued2025-12-16
dc.description.abstractAntimicrobial resistance in coastal ecosystems represents an increasingly environmental and public health concern, and Escherichia coli is the predominant species in this scenario in Brazil. So, this study characterised E. coli isolates resistant to clinically relevant antimicrobials recovered from wild-harvested marine bivalves from Southeast Brazil, along a one-year surveillance study. Sampling was carried out at ten different sites at the Atlantic coast of Espírito Santo State. E. coli isolates obtained from selective media were identified by MALDI-TOF, evaluated for antimicrobial resistance profiles by phenotypic and molecular methods, and had phylogroups and clonal profiles evaluated by Clermont method and ERIC-PCR, respectively. A total of 151 isolates were recovered, of which most (90.73%) showed MAR index values > 0.2. ESBL production was predominant (93.38%), mainly codified by blaCTX-M-like genes. AmpC-producing isolates, carrying blaCMY-like; carbapenem-resistant strains, harboring blaKPC-2 or blaNDM-1; fluoroquinolones-resistant isolates, carrying qnrA, qnrB, qnrS or aac(6′)-Ib; and mcr-1-positive isolates, were also identified. Phylogrouping analysis revealed a predominance of commensal groups (E, A, and B1), while virulenceassociated phylogroups were less frequent. ERIC-PCR analysis revealed clonal diversity, with 19 clusters, and evidenced both long-term stability and geographic dissemination. Besides, the detection of different antimicrobial resistance genes in isolates from identical fingerprint patterns suggests horizontal gene transfer. Finally, occurrence of high-risk antimicrobial resistance determinants in marine bivalves poses potential threat to environmental and food safety, as well as public health, reinforcing the urgency of integrated surveillance strategies within a One Health approach.
dc.description.resumoA resistência antimicrobiana em ecossistemas costeiros representa uma crescente preocupação ambiental e de saúde pública, sendo E. coli a espécie predominante nesse cenário, no Brasil. Assim, este estudo caracterizou isolados de E. coli resistentes a antimicrobianos clinicamente relevantes, recuperados de bivalves marinhos coletados diretamente de seu habitat natural, no Sudeste do Brasil, ao longo de um ano de estudo de vigilância. A coleta foi realizada em dez diferentes locais na costa atlântica do estado do Espírito Santo. Os isolados de E. coli, obtidos em meios seletivos, foram identificados por MALDI-TOF, avaliados quanto aos perfis de resistência antimicrobiana por métodos fenotípicos e moleculares e tiveram os filogrupos e perfis clonais avaliados pelos métodos de Clermont e ERIC-PCR, respectivamente. Um total de 151 isolados foi recuperado, dos quais a maioria (90,73%) apresentou índice MAR > 0,2. A produção de ESBL foi predominante (93,38%), principalmente codificada por genes do tipo blaCTX-M-like. Isolados produtores de AmpC, carregando blaCMY-like; cepas resistentes a carbapenêmicos, portando blaKPC-2 ou blaNDM-1; isolados resistentes a fluoroquinolonas, carregando qnrA, qnrB, qnrS ou aac(6′)-Ib; e isolados positivos para mcr-1, também foram identificados. A análise de filogrupos revelou predominância de grupos comensais (E, A e B1), enquanto filogrupos associados à virulência foram menos frequentes. A análise por ERIC-PCR revelou diversidade clonal, com 19 agrupamentos, e evidenciou tanto estabilidade temporal quanto disseminação geográfica desses isolados. Além disso, a detecção de diferentes genes de resistência antimicrobiana em isolados com perfis genéticos idênticos sugere transferência horizontal de genes. Por fim, a ocorrência de determinantes de resistência antimicrobiana de alto risco em bivalves marinhos representa potencial ameaça à segurança ambiental e alimentar, assim como à saúde pública, reforçando a urgência de estratégias integradas de vigilância dentro da abordagem de Uma Só Saúde.
dc.description.sponsorshipAgência de fomento
dc.formatText
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufes.br/handle/10/20808
dc.languagepor
dc.language.isopt
dc.publisherUniversidade Federal do Espírito Santo
dc.publisher.countryBR
dc.publisher.courseMestrado em Doenças Infecciosas
dc.publisher.departmentCentro de Ciências da Saúde
dc.publisher.initialsUFES
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Doenças Infecciosas
dc.rightsopen access, restricted access ou embargoed access
dc.subjectMoluscos
dc.subjectMicrobiologia marinha
dc.subjectTestes de sensibilidade bacteriana
dc.subject.cnpqDoenças Infecciosas e Parasitárias
dc.titleCaracterização de isolados de escherichia coli resistentes a antimicrobianos clinicamente importantes em bivalves marinhos nas cidades de Vitória e Vila Velha, Espírito Santo
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dc.typemasterThesis
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